成都蔬菜有机肥既不能用量不足，也不能过量使用。过量施用有机肥导致土壤中铵盐浓度高，导致蔬菜烧根，植物因烧根死亡，生长过快，导致大量落花落果。 用有机肥种植蔬菜，有机肥太靠近根系或有机肥直接接触根系等，会容易造成烧根等肥害。
有机肥的科学施用。 有机肥适合做基肥施用。菜地不要施未腐熟的有机肥。有机肥要深施于土壤，不要施于畦面，以免养分淋失。在翻耕菜地前，应先撒施所需的有机肥，然后翻耕1 ~ 2次，可有效保持和延长有机肥的肥力。在种植蔬菜前，将有机肥埋在种植沟或种植穴中，种植前用薄土覆盖，具有保肥和延长供肥期的良好效果。
冬春低温，发酵50-60天即可分解。牛粪等猪粪密闭发酵时，前期较高温度可达60 ~ 70℃。此外，肥料中的大多数病原微生物、害虫、虫卵、杂草种子等会因密闭发酵造成的缺氧和大量有毒气体而被杀死。 如果有沼气池，可以把未消化的猪、牛、人畜粪便放进去，让它发酵产气，然后用沼渣、沼液给蔬菜施肥，生态环保。