生物有机肥是以固氮菌、解磷菌、解钾菌、分解菌等有益微生物，加人自然界中的有机物为基质和载体，经特殊工艺加工而成的有机肥料，生物有机肥是以畜禽、农作物秸秆、生活垃圾等有机废弃物为基质，经过无害化、腐熟处理而制成的一类兼具有机肥和微生物功效的肥料，含有氮、磷、钾、微量元素等无机成分，以及有利于提高土壤肥力、促进作物吸收和元素释放等特定功能的微生物，合理施用生物有机肥不仅能够减少畜禽粪污等污染物的排放，以及农作物秸秆等农业废弃物的随意焚烧和堆放，降低化肥和农药使用量，还可以提高农产品质量，促进有机食品生产，增加农民收入。
物料是否均匀？产品含水量太高或太低均不利于菌种存活：抓一把肥料在阳光下观察，阴潮呈团、干燥呈灰都非正常产品，适合特殊功能菌种生长的"有机肥营养"由多种有机营养物质组成（如：菜粕、黄豆粉等发酵制成），在光线下能看到原料的痕迹，或者能闻到原料的特殊气味，生产生物有机肥zui主要原料包括城市生活垃圾、城市污泥、集约化禽畜、农作物秸秆，农产品加工副产品（苹果渣、菇渣），添加多功能发酵菌种剂，通过独特的连续池式好氧发酵技术生产的高效活性生物有机肥。
在生物有机肥中有机质的检测方法上，我国采用重铬酸钾氧化法测定有机质，主要原理是测其中的C含量，然后转化成有机质，但是其中可能会存在一些漏洞，比如用无机碳冒充有机碳，降低生物有机肥的效果，所以需要更新相关的标准，在生物有机肥生产上面，目前还处于相对原始的方法，生产工艺简单，科技含量较低，所以需要注重研究，尤其是在微生物技术上，一些企业夸大生物有机肥的作用，在某些指标上面有所隐藏，使得生物有机肥效果受限。