什么是生物有机肥？生物有机肥是指特定功能微生物与主要以动植物残体（如畜禽、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料，生物有机肥中的有益微生物进入土壤后与土壤中微生物形成相互间的共生增殖关系，制止有害菌生长并转化为有益菌，相互作用，相互促进，起到群体的协同作用，有益菌在生长繁殖过程中产生大量的代谢产物，促使有机物的分解转化，能直接或间接为作物提供多种营养和**性物质，促进和调控作物生长。
生物有机肥回收利用农业废弃物，减少环境污染，对人、畜、环境无公害，是一种环保型肥料，生物有机肥，是有机肥的一类，有机肥在商品化生产过程中利用微生物的发酵和分解，可以是自然发酵也可以是添加人工菌种干预发酵，达到充分分解充分杀菌的目的，优质商品有机肥的优点：培肥地力，养分全；使用安全；含有多种营养成分，肥效长有后劲；提高化肥利用率，减少化肥用量；提高土壤有益微生物活性；改良土壤，培肥地力；调节土壤酸度；增强植物抗病性和抗逆性；提高产量，改善品质。
就目前有机农业生产来说，首先对于城市垃圾和城市污泥，包括含有一些重金属类的工业化的未经高温或者无害化处理的作为原料的有机肥，我们应该排除在外，有机肥生产工艺主要有完全发酵和半发酵两种，主要看是否经过了高温灭菌过程，然后才能判断是否经过了无害化处理，粉状有机肥的检验方法是，直接把粉状有机肥放在一杯水里，如果是漂浮的，那么就是一个合格的有机肥，如果直接下沉，那么这个有机肥就可能有问题，因为有机质要比水轻。