有机肥料含有丰富的有机质和作物所需的多种营养元素是一种完全肥料，对改良土壤、增肥地力和无公害蔬菜的生产具有独特的作用，猪、牛粪等有机肥对蔬菜的产量和品质等有重要影响，有机肥施用适量，蔬菜产量高、品质佳、土壤肥力得以提升和维持；有机肥施用过量或施用不正确会产生肥害，轻的障碍植株生长发育，致产量下降和土壤生态恶化等，严重的植株全部或部分枯死、产量大减或绝收，施用没腐熟的有机肥，会污染土壤和四周环境、死苗和枯株增加、病虫草害加重等。
科学施用有机肥，有机肥zui适合作基肥施用，没经腐熟的有机肥，不要施于蔬菜地中，有机肥宜深施于土壤中，不要施于畦面，以免养分淋溶流失等，菜地翻耙前，先撒施所需的有机肥，后再翻耙1～2次，可高效保持和延长有机肥的肥力，蔬菜定植前，将有机肥埋施于定植沟或穴，用薄土盖肥后再定植，有好的保肥和延长供肥期等作用，猪牛粪等密闭发酵时，前期堆内zui可达60～70℃,加上密闭发酵造成的缺氧和产生的大量有毒气体等，肥中绝大部分病原微生物和害虫、虫卵、杂草种籽等会被杀死。
已发生肥害的蔬菜，受害较轻的，通过采用以上方法，多可得到解救，肥害发生重的蔬菜，是不可逆的，不要解救，要全部拨除，过些天改种其它蔬菜，有机肥区别于化肥，有机肥的原材料主要来源于大自然，可谓是“取之于自然，用之于自然”，营养丰富；而化肥是通过化学制剂合成，可谓“无中生有”，养分单一，什么是有机肥，广义上讲：俗称农家肥，包括以各种动物、植物残体或代谢物为原材料组成，如人畜、秸秆、动物残体、屠宰场废弃物等。