这类有机肥的使用方法很简单，只需按所购有机肥产品的使用说明书即可，但是需要注意，即使是处理过的肥料，也不要用得过多，夏天高温时，处理过的有机肥依然会释放速度加快，且自身散发热量，需要减少用量，在施用有机质后，可有效改善土壤理化状况和生物性状，使土壤熟化，提高供肥能力和缓冲能力，为作物生长创造良好的土壤条件，有机固体废弃物在密闭发酵罐中连续好氧发酵7天左右，经微生物发酵、除臭、分解后，加工成鸡粪有机肥，可用于农作物。
有机肥发酵罐是一种环保设备，利用自然界微生物的分解作用，菌种和原料同时放入，发酵结束后，再补料时无需添加菌种，在罐内繁殖产生的微生物可以实现连续发酵，商品有机肥是生产厂家经过加工处理过的有机肥，其病虫害及杂草种子等经过了高温处理基本死亡，可以直接施入农田，有机无机复混肥料由有机和无机肥料混合或化合制成，既含有一定比例的有机质，又含有较高的养分，这与我国当前科学施肥所提倡的“有机和无机相结合”的原则是相符的。
商品有机肥原料来源主要有：蓄禽、城市污泥、工业废渣、农作物秸杆等，目前，我国商品有机肥料大致可分为精制有机肥料、有机无机复混肥料、生物有机肥料三种类型，精制有机肥料指经过工厂化生产，不含有特定肥料效应微生物的商品有机肥料，以提供有机质和少量养分为主，精制有机肥料作为一种有机质含量较高的肥料，是绿色农产品、有机农产品和无公害农产品生产的主要肥料品种，生物有机肥料指经过工厂化生产，含有特定肥料效应微生物的商品有机肥料，除了含有较高的有机质外，还含改善肥料或土壤中养分释放能力的功能性微生物。