辣椒种子主要种植在中央胎座上，种子密度与胎座延伸长度呈负相关。所以辣椒种子密度高，而牛角椒、线椒密度低。在植物营养不良、光照不足、长期低温、土壤干燥、种植密度高的条件下，胎座上的种子很少。相反，在营养供给好、光照充足、温度适宜、土壤水分协调、种植密度合理、植株生长健壮的条件下，胎座上的种子多，辣椒种子发育质量好，增产潜力大。这些都是良种选育中值得重视的。
辣椒种子的质量决定了辣椒种植的产量和质量，种植者也会更加重视辣椒种子。往往就会想办法找到好的胡椒种子。辣椒种子的价格受品种影响。辣椒分很多品种，有的卖的好，有的卖的差。市场上卖的比较好的辣椒价格会相对高一些，这个品种的辣椒种子价格也会相对贵一些。不过普通辣椒种子价格相对便宜。所以一斤辣椒种子成本多少要考虑到辣椒种子的品种。
辣椒种子生长发育的基础是土壤。在其生长发育过程中，根系生长所需的养分、水分和氧气都来自土壤。土壤的理化性质直接影响土壤肥力和土壤养分及水分的有效性。封育的理化性质不仅与土壤类型有关，还与土壤管理水平密切相关。如果土壤管理不适应辣椒的品种、类型和适宜的栽培环境，就难以维持土壤肥力和高水平的生产力，产量也不稳定，经常出现异常波动。