沼气分析仪配有疏水过滤器，这样可以防止样气中的冷凝物进入分析仪；箱子的外部被加热到比环境温度高5°C，以防止水汽凝结。基本样气预处理包括外部收集过滤器和水收集器。
沼气分析仪主要试验气体是CH4、CO2、O2和H2S。在现场测试过程中，结合现场应用经验和返厂维修仪表的情况，需要注意以下问题:客户对生产的沼气非常确定，对检测样气数据有疑问，但现场没有标准气进行验证。实验室发酵沼气量很少，但需要每天监测，样气不足导致仪器测试值不协调不稳定。沼气含有大量的水。如果除水失败或除水效果不好，沼气进入时会将液态水带入仪器，造成传感器污染，仪器无法正常使用。
针对以上常见问题，解决方法如下:在销售过程中，主张给客户配备标准气。当客户对检测样气有疑问时，可以检测标准气，验证是仪器问题还是沼气生产工艺问题。现场沼气产值少，导致测试值不好。可以和客户交流，收集沼气过水后，直接提取到沼气分析仪中。沼气分析仪配有预处理。针对水分较多的现场，建议在预处理后加入一个除水过滤器，可以有效去除沼气中的水分和污染物，保证仪器的传感器不进水。