木箱制作好后，需要放在合适的仓库采取一些方法进行存储，避免出现发霉、损坏、虫蛀等等状况，不然会无法被正常使用，造成了损失。木箱入库前应检疫除害：热处理，确保木质材料的温度大约56℃，时间达半小时。熏蒸，可直接利用溴甲烷来做熏蒸，温度10℃，时间一刻钟。要预先检查木箱内含有的水分是不是在标准范围内，结构和质量是否满足包装要求，是否含细菌、害虫等。不然不可装进库里。库房必须保证干燥、通风，以免受潮腐烂、细菌滋生。木箱在装货后，为避免在运输途中遇下雨天气而受潮，应提前为木箱做好防雨工作，用塑料薄膜整体包裹。木箱的保存工作没做好，正式使用时会出现很多问题，货物的质量和安全也会受到影响。
其外观和性能远优于使用的天然木质包装，但是在下雨绵绵的季节怎么防止木箱发霉、出现霉斑呢？，由于木纤维里面含有大量的蛋白质、淀粉，油脂类等等营养物质，所以木材非常适合霉菌生产繁殖，由于货运途中时间比较久，尤其是在海上的运输，早晚温差大形成的水蒸气导致湿度过大，霉菌的繁衍速度就会变得很快，预防措施：，熏蒸：此方法主要是针对出口的大型包装箱进行杀虫，而且有效期比较短，热处理：要规格：可根据客户需求定制任何尺寸，类型：两面或四面叉，起重机吊装，熏蒸消毒证书：免熏蒸，植物检疫证书：免检疫，特征：，采用度镀锌钢带连接，承载能力、抗压性能优良，更耐用，更轻更美观，可喷印，重量为传统产品的30%~40%，堆垛性能好，优良的气候耐受性，适应从热带到严寒的各种恶劣气候，木箱的特点是：易于加工，锯、刨、钻、凿、钉均可；具有优良的强度和重量比，有一定的弹性、能接受冲击、振荡、重压等效果。有一定的设施，而且处理成本比较高，可以降低木材中水份含量，但解决不了根本问题。
熏蒸木箱安装简便，包装箱采用钢带连接，钢带环扣紧固，安装简便。符合海关开箱检验和无损回收的要求，也符合进口国节约劳动力成本的要求。此外，木箱外形美观，箱子表面干净大方，表面光滑平整，便于在箱子上印刷图形和文字，提高产品的形象。熏蒸木箱性能可靠包装箱由抗拉强度极高的钢带制成边、角，可以有效地降低箱子边和角的破损率。