木箱制作好后，需要放在合适的仓库采取一些方法进行存储，避免出现发霉、损坏、虫蛀等等状况，不然会无法被正常使用，造成了损失。木箱入库前应检疫除害：热处理，确保木质材料的温度大约56℃，时间达半小时。熏蒸，可直接利用溴甲烷来做熏蒸，温度10℃，时间一刻钟。要预先检查木箱内含有的水分是不是在标准范围内，结构和质量是否满足包装要求，是否含细菌、害虫等。不然不可装进库里。库房必须保证干燥、通风，以免受潮腐烂、细菌滋生。木箱在装货后，为避免在运输途中遇下雨天气而受潮，应提前为木箱做好防雨工作，用塑料薄膜整体包裹。木箱的保存工作没做好，正式使用时会出现很多问题，货物的质量和安全也会受到影响。
滑木箱：选用滑木结构的底盘，旁边面和端面选用箱板、箱档制成的木箱，封闭木箱：箱面用木板等钉合或制成的封闭状况木箱，格箱：箱面用木板条等钉合制成的栅栏状木箱，钢丝捆扎箱：用钢丝将箱板衔接组成各箱面，并用箱档加固制成的木箱，胶合板箱：胶合板箱：用木材作箱档，用胶合板作箱面制成的木箱，竹胶合板箱：用木材作结构或箱档，用竹胶合板或木胶合板作箱面制成的木箱，木结构瓦楞纸箱：结构选用木质，箱面选用瓦楞纸板制成的复合木纸箱。
熏蒸木箱安装简便，包装箱采用钢带连接，钢带环扣紧固，安装简便。符合海关开箱检验和无损回收的要求，也符合进口国节约劳动力成本的要求。此外，木箱外形美观，箱子表面干净大方，表面光滑平整，便于在箱子上印刷图形和文字，提高产品的形象。熏蒸木箱性能可靠包装箱由抗拉强度极高的钢带制成边、角，可以有效地降低箱子边和角的破损率。