洁净实验室使用的空调通风系统主要由空气处理设备、粗高效过滤器、空气输送设施和局部净化设备组成，它们的类型和功能各不相同。空气处理设备:一般空气处理设备是由空调(AHU)、新风机组(MAU)、循环机组(RAU)组成的成套机组，常用于空调净化系统中的空气热湿交换和空气净化处理。适合有一定规模的实验室净化工程，但是需要其他过滤器和净化装置的整体配合，所以投资比较高。相对较小的实验室空气处理设备由分立的小型设备组成，比如利用冷暖空调作为冷热源，对空气的温湿度进行简单的处理，然后配备风机过滤机组(FFU)对空气进行净化，这是一种相对简单的净化方案。
净化工程是指对产品接触的大气的洁净度、温度和湿度的控制，使产品能在良好的环境空间中生产制造。这个环境空间的设计和建造过程可以称为净化工程。净化工程是指专门设计的房间，在一定的空间范围内排除空气中的悬浮颗粒、有害空气、细菌等污染物，将室内温度、洁净度、室内压力、气流速度及分布、噪声与振动、照明、静电等控制在一定的需求范围内。净化工程是一个房间。无论外界空气条件如何变化，房间都能保持原来设定的洁净度、温度、湿度、压力等性能。净化工程俗称无尘车间、净化车间、洁净室等。
实验室净化工程不仅起到保护实验样品安全的作用，也是保证实验成功和实验人员安全的重要措施之一。实验室净化工程是将实验室的某一区域开辟出来，专门用于建造空气洁净，对实验环境要求相对较高的实验室或无菌室。实验室净化工程系统其实和传统的洁净室系统差不多，只是洁净室的压力、微生物控制、温湿度控制比工业洁净室更严格。常见的实验室净化工程装修材料有夹层彩钢板、钢化玻璃、防火板等。洁净实验室必须按照洁净室施工及验收标准，采用密封性好、不产生粉尘的材料进行隔断和吊顶装修。洁净实验室的通风系统一般采用组合式空调机组。