当易碎生物或物料的交叉污染会危及产品降雨或人身安全时，还应采取安全可靠的技术措施防止交叉污染，如严格控制不同选定GMP车间净化之间的静压差，合理划分净化空调系统，按要求合理设计回风系统等。GMP车间净化的设计是各种专业设计技术的综合，尤其是GMP车间净化的工艺设计、洁净建筑设计、空气净化设计以及各种有特殊要求的设计技术的综合设计，紧密配合，相互渗透，合理安排。GMP车间净化工程设计应符合工艺(或使用)流程。
随着技术的发展，对产品的高精度和小型化的需求更加迫切，如超大规模集成电路的研究和制造就需要洁净的生产车间。比如半导体的生产，需要洁净室来保证工作环境中的颗粒和温湿度达标，任何不达标的颗粒和温湿度都可能影响制造设备的性能和可靠性。车间净化工程应用于医疗行业，有了手术室净化工程，术后感染率从8.9下降到0.26。手术室净化已经成为医院医疗水平的重要标志，尤其是一些大型医院，需要先进的净化手术室为器官移植等困难复杂的手术提供合适的空间。
一般情况下，内门通常只沿门缝设置一圈密封条，一条密封线就够了。而材料人群的外门和洁净车间的生产区直接通向外门。为了可靠地防止室外空气对人的侵害，除了气闸和双扇门，而且建筑和风机的截面比一般内门大得多，通常用两条密封条形成两道密封线。为了使密封条满足截面小、受力后压缩量大的要求，并与受压构件有足够的接触和良好的密封条件，通常制成不同种类的橡胶空心薄壁异型管；而且大部分都是成型品。有多种截面形式，嵌入位置和方式不同。