车间净化工程有六个主要组成部分，即:地面系统、风道系统、自动控制系统、电气系统、给排水系统和空气过滤系统。
净化车间选址应符合有利生产、方便生活、节省投资和运行费用的原则。在进行工厂设计建设时，需要在保证后期质量的同时，尽可能减少前期投资，有效降低或控制运行成本。工程施工前，应对现场进行整体平面划线放样，复核现场实际尺寸，使建筑结构地面水平度符合要求。
净化车间工程应对空调、设备、水电、管道等进行系统、全面的设计和布置。在整个车间，并充分考虑安装和未来的维修。厂房整体结构牢固稳定，墙体顶面无划痕、毛刺、胶痕，接缝牢固、光滑、无晃动，门窗应轻便、开闭灵活可靠，密封状况良好等。电源和灯具安装整齐、美观，正常开启，照明照度符合要求，电源充足，满足正常工作标准。
强化施工现场现场管理规范和施工管理制度，控制人流物流造成的区域污染。严格按顺序施工，做到衔接合理，避免返工，造成材料浪费、成品受损。材料进场 洁净厂房构件应按施工进度计划要求，运抵安装现场，轻搬轻放，避免划伤，并分类整齐堆放，严加保管，严格控制材料规格、性能和完好程度，不合格或已损坏的构件材料严禁安装。随时保持施工现场清洁无尘，在施工过程中随时对部位和场地进行清洁和擦拭。