洁净室净化工程设计是由相关专业综合完成的设计技术，类似于船舶工业场地设计，但也有自己的特点，根据洁净室净化工程所生产产品的类别、品种或用途，决定设计洁净室净化工程的控制对象和技术要求。在洁净室净化工程中，控制对象是空气中的粉尘，以不同产品和用途作为微生物的洁净室净化工程，与空气洁净度等级的要求、空气中所含微生物的种类和浓度、差异等无关。
集成电路生产洁净室净化工程。控制对象主要是根据集成电路的特征尺寸和集成度作为空气中的灰尘，对空气洁净度等级、防微振、高纯度物质等有不同的要求。所以工厂的具体产品品种必须统一确定。为保证洁净室建设净化过程中必要的空气洁净度，洁净室净化工艺设计相关的各种专业设计减少或防止室内粉尘和微生物的产生，严格控制不同洁净室净化工艺之间的静压，并按要求提供洁净空调系统，当洁净室净化工艺中颗粒微生物和物料与易碎粉尘和物料交叉污染危害产品降雨和人身安全时。
洁净室净化工程设计是各种专业设计技术的综合设计，特别是工艺设计、洁净建筑设计、空气净化设计以及各种有特殊要求、相互渗透、合理配置的设计技术的综合设计。洁净室净化工程设计适应工艺(或使用)流程，合理选择各种设备和装置，实现人流和物流的顺畅、快速流动，气流类型选择适当，洁净空调系统配置合理，各种特殊要求的技术措施适当。