实验室净化系统布局，从目前情况来看，国内大部分二级医院都在积极开展基因扩增实验室项目，其中PCR实验室的设计和建设越来越受到医学界的重视。按照实验流程，房间功能为样品制备区、样品制备区、基因扩增区、产物分析区。规范中没有对该区域的清洁度提出要求。如果这个区域有空调，可以净化到10万的洁净度。一般情况下，标准的实验楼布局需要一个公共走廊，四个相邻的功能测试区，每个测试区设置一个独立的缓冲区，可以通过不同的压差进行控制，避免室内空气的串联和二次污染。
实验室净化主要检测区域的压力梯度和气流方向为:试剂制备区、标本制备室、扩增区、产物分析区和测序室。压力梯度不能混乱，气流方向不能停滞或向后。同时，每个区域的缓冲室侧与主测试区域之间的压力差为+5Pa，以防止污染空气从测试区域流向非污染区域。另外，PCR实验室要充分通风，但同时也要考虑夏季和冬季的室内温度过程要求和舒适度要求。
洁净实验室装修常用材料选择要求:实验室的天花板采用防尘、光滑、阻燃的彩钢板，两面用槽铝密封，彩钢板用中性中国白玻璃胶密封。实验室净化区域专用PVC地板胶铺地，防火等级Bl，耐酸、耐碱、耐腐蚀、耐磨性能符合国家标准实验室要求；实验室墙壁采用防尘、光滑、防火的彩钢板，钢板夹层。地槽采用50X30槽铝，地槽用钢钉和木块固定。与地面和墙面、墙面和墙面、墙面和顶棚的过渡采用半径为50mm的铝合金圆弧处理；彩钢板与彩钢板之间用中性中国白玻璃胶密封，防止裂缝滋生细菌。