我们一般要选择一些秸秆或者一些粮食下脚料，或者一些油类、豆粕类、花生粕类的含有植物蛋白的这类原料所生产的有机肥，这种有机肥经过高温和无害化处理，本身就有一个很强的螯合作用，进入到土壤以后，能够养活大量的微生物，而且可以直接供给作物营养吸收，同时这些有机质是多种复合酸的合成，可以螯合土壤中大量的元素，所以使用这种有机肥的时候，可以解决土壤一个微环境的问题，同时也能解决作物地上部生长的生理变化问题，并且能够持续的改良土壤，生产出优质的农产品。
生物有机肥回收利用农业废弃物，减少环境污染，对人、畜、环境无公害，是一种环保型肥料，生物有机肥，是有机肥的一类，有机肥在商品化生产过程中利用微生物的发酵和分解，可以是自然发酵也可以是添加人工菌种干预发酵，达到充分分解充分杀菌的目的，优质商品有机肥的优点：培肥地力，养分全；使用安全；含有多种营养成分，肥效长有后劲；提高化肥利用率，减少化肥用量；提高土壤有益微生物活性；改良土壤，培肥地力；调节土壤酸度；增强植物抗病性和抗逆性；提高产量，改善品质。
就目前有机农业生产来说，首先对于城市垃圾和城市污泥，包括含有一些重金属类的工业化的未经高温或者无害化处理的作为原料的有机肥，我们应该排除在外，有机肥生产工艺主要有完全发酵和半发酵两种，主要看是否经过了高温灭菌过程，然后才能判断是否经过了无害化处理，粉状有机肥的检验方法是，直接把粉状有机肥放在一杯水里，如果是漂浮的，那么就是一个合格的有机肥，如果直接下沉，那么这个有机肥就可能有问题，因为有机质要比水轻。
