采用穿梭式货架系统加穿梭子母车、提升搬运存储系统等构成的体系，称子母穿梭式立体库，是穿梭式货架结构体的功能性加强，让双向直线行驶的穿梭子车结合双向直线行驶的母车实现平层仓储单元物品的无缝对接与位移作业，提升机则实现穿梭子车或存储物品的换平层作业，以实现存储单元在整个存储区域内的三维动态化存储管理，是穿梭式立库建设的技术性嫁接与延伸，目前多为穿梭车设计制造企业、货架企业或系统集成商推介的主流仓储管理形式之一；
贯通式货架和穿梭式货架都属于密集型的仓储货架，有效提高库房存储空间。这两种货架都需要借助叉车来进行存储作业。穿梭式货架需要利用叉车将货物放置在货架的一端，然后再由穿梭小车将货物放到指定的位置上。贯通式货架的存储方式和穿梭式货架不同，因为其没有设计叉车通道，所以存储货物时，需要叉车到货架内部存储货物，通常会在叉车通道中设置安装叉车导轨。 穿梭车货架具备自动化的功能，但是贯通式货架没有；贯通式货架造价成本相比较穿梭式货架要低；贯通式货架主要和叉车配合使用，而穿梭式货架通常和其他自动设备一起搭配使用。
子母穿梭车货架是分子穿梭车和母穿梭车两种，货物由母穿梭车运送到各个子穿梭车上，子穿梭车再把货物自动输送到相应的货位上，取货则相反。 从结构及货物存取方式看，子母穿梭车重型货架的优势是非常明显的，可以实现货物全自动化存取，提高了仓库作业效率。因为是穿梭车运送货物，中间无需预留叉车通道，实现货物密集型存储。这是子母穿梭车货架的两大优势，适用于多量少样的食品、饮品、化工、烟草等单品种批量大，品项相对单一的行业。