在所有传统的货架中，穿梭式货架应该是一种比较高档的立体存储设备了。这种货架系统上逐渐有了自动化作业水准，用的好了，比主副架组合式的货架效率更高、配合货物分拣更科学。但需要注意的是，这种货架的定制，其成本显然比一般货架投入更多，需要一定的库房面积使用。 穿梭式货架是穿梭车与货架部分有机结合的产物，二者只有配合、优化好了，才能让真个存储系统高效运作。由于它是依靠自动小车将托盘货物依次移动到指定位置的，是一种密集式的储物方式，故它们比较适应用于单一批次产品数量多而货物批次少的产品上使用，这样可以较大程度的发挥其效能。
贯通式货架和穿梭式货架都属于密集型的仓储货架，有效提高库房存储空间。这两种货架都需要借助叉车来进行存储作业。穿梭式货架需要利用叉车将货物放置在货架的一端，然后再由穿梭小车将货物放到指定的位置上。贯通式货架的存储方式和穿梭式货架不同，因为其没有设计叉车通道，所以存储货物时，需要叉车到货架内部存储货物，通常会在叉车通道中设置安装叉车导轨。 穿梭车货架具备自动化的功能，但是贯通式货架没有；贯通式货架造价成本相比较穿梭式货架要低；贯通式货架主要和叉车配合使用，而穿梭式货架通常和其他自动设备一起搭配使用。
子母穿梭车货架是分子穿梭车和母穿梭车两种，货物由母穿梭车运送到各个子穿梭车上，子穿梭车再把货物自动输送到相应的货位上，取货则相反。 从结构及货物存取方式看，子母穿梭车重型货架的优势是非常明显的，可以实现货物全自动化存取，提高了仓库作业效率。因为是穿梭车运送货物，中间无需预留叉车通道，实现货物密集型存储。这是子母穿梭车货架的两大优势，适用于多量少样的食品、饮品、化工、烟草等单品种批量大，品项相对单一的行业。